故事發生在戰國時代普通人家出身的男孩豬名寺亂太郎祖輩曾是忍者在父親的勸說下他離開家鄉攝津進入當時一流的忍者學園學習在學校他認識了與之同齡的新兵衛和霧丸新兵衛是一個出身富商家庭的小胖子為人迷迷糊糊對吃尤為感興趣；霧丸則是身世貧苦的孤兒為人精明貪財吝嗇這三個性格迥異卻的小家伙成為好朋友他們最大的共同點就是經常因為考試不及格受到處罰當然以校長大川平次渦正為首的老師們也都是性格古怪且鮮明的爆笑人物亂太郎他們和周圍的同學、老師一起上演了連番搞笑、有趣的精彩好戲…… 　　本片根據漫畫家尼子騒兵衛原著《落第忍者亂太郎》改編改編成動畫時因NHK電視臺的禁忌而將“落第”二字去掉